แผ่น PCR สีสามารถใช้เป็น DNA RNA ปลอดเชื้อได้

Color PCR (การทดสอบการเติมสี) แปลตามตัวอักษรว่า"การตรวจจับการเติมเต็มสี" ซึ่งเป็นชนิดของ LP-PCR PCR สีมีการแปลที่ชัดเจนกว่า: ใช้สีย้อมเรืองแสงเพื่อติดฉลาก 5' ปลายไพรเมอร์ สีย้อมเรืองแสง JOE และ FAM เป็นสีเรืองแสงสีเขียว TAMRA เป็นสารเรืองแสงสีแดง COUM เป็นฟลูออเรสเซนต์สีน้ำเงิน ไพรเมอร์ที่มีฉลากเรืองแสงต่างกันมีส่วนร่วมในปฏิกิริยาในเวลาเดียวกัน และยีนเป้าหมายที่ขยายแล้วจะมีสีย้อมอยู่ที่ 5' สิ้นสุดไพรเมอร์ ด้วยอิเล็กโตรโฟรีซิสหรือการตกตะกอนแบบแรงเหวี่ยง ตาเปล่าสามารถตัดสินว่ามียีนเป้าหมายอยู่หรือไม่และชนิดของยีนที่ขยายตามสีของแสงเรืองแสงที่แตกต่างกัน . โดยปกติจำเป็นต้องใช้ไพรเมอร์สองสีที่แตกต่างกันเท่านั้น ไพรเมอร์หนึ่งใช้เป็นไพรเมอร์สำหรับการตรวจจับยีน อีกส่วนหนึ่งใช้เป็นตัวควบคุมภายในเพื่อควบคุมเงื่อนไขในการวินิจฉัยการลบยีน การโยกย้ายโครโมโซม หรือการติดเชื้อไวรัสบางชนิด เมื่อตรวจพบการกลายพันธุ์หลายจุด สามารถใช้สีได้มากขึ้น ตัวอย่างเช่น โรคทางพันธุกรรมที่มีการกลายพันธุ์หลายจุด สงสัยว่ามีการติดเชื้อไวรัสหลายตัว และการวิเคราะห์ไซต์ HLA สามารถใช้ PCR สีเพื่อตรวจหาไซต์หลายแห่งพร้อมกันได้